深圳的港口主要包括以下這些：
蛇口港。位於深圳市蛇口半島南端，是中國最大的轉運中心之一，是華南地區重要的集散中心和中轉口岸。
赤灣港。位於深圳西部南頭半島頂端，是一箇重要的深水港，主要經營集裝箱、散雜貨、油氣品等。
媽灣港。位於深圳西部，主要經營散雜貨、液體化工產品、油品和煤炭等。
鹽田港。位於深圳市南大鵬灣北岸，是一箇深水無沙良港，以歐美航線爲主。
大鏟灣港。位於深圳西部寶安區，是深圳西部港區內的全新世界級集裝箱碼頭。
沙魚湧港。位於深圳，是一箇重要的港區。
下洞港。位於深圳，是一箇重要的港區。
東角頭港。位於深圳，是深圳港區的一部分。
福永港。包括一箇位於深圳寶安國際機場附近的碼頭，是深圳機場“空海聯運”的重要配套設施。
內河港區。位於深圳，服務於珠江三角洲地區。