《深夜食堂》講述的是一家只在夜晚營業的餐館中發生的故事。
這家餐館從午夜12點到早晨7點開放，顧客可以享受到簡單美味的家常菜和溫暖感人的日常故事。餐館的菜單雖然以豬肉醬湯套餐爲主，但老闆能夠根據客人的要求和現有食材製作出各種料理。每個來到這家餐館的客人，都會在食物和故事中找到共鳴，講述自己的故事，包括上班族、脫衣舞娘、流行巨星等各色人物。這些故事通常涉及友情、愛情、家庭和個人成長等主題，展現了人性的複雜性和普遍性。
整部作品以食物爲媒介，展現了人與人之間的連接和情感交流，強調了尊重和照顧每一箇客人的喜好，以及對孤獨個體的關注。