深水螃蟹的品種包括：
紅肚蟹。這種螃蟹生長速度快，肉質肥美，適合深水養殖。
麪包蟹。體型較大，肉質細膩，味道清甜，適合深水養殖。
箭腳蟹。體型較小，肉質鮮美，對水質要求較高，適合深水養殖。
龍蝦螃蟹。肉質豐富，適應性強，對水質要求較高，適合深水養殖。
無爪蟹。體型小，肉質細嫩，對水質要求不高，容易養殖。
中華絨螯蟹。適合深水養殖，肉味鮮美。
水晶螃蟹。適應性強，性情溫順，肉質肥美。
紅脅蟹。適應力強，口感好，適合深水養殖。
花蟹和青蟹。適應深水環境，主要分佈在南方海域和西南海域。
大閘蟹。在深水中也可以生存，產卵量高，肉質鮮美。
紫惡魔蟹（Geosesarma Dennerle）。原產於亞洲印尼蘇拉維西島，白天躲避於陰涼處，夜晚出來活動。
豹點蟹。原產於亞洲印尼蘇拉維西島，是少數可以深水飼養的河蟹品種之一。
這些品種中，有的更適合淡水環境，有的則更適合海水環境，養殖時需要注意其生活習性和水質要求。