清代的行政區劃系統主要遵循「省—府（直隸州、直隸廳）—縣（散州、散廳）」的三級制。在內地十八個省份，即漢人主要分布區，這一制度大體上與明朝相承接。省是最高一級行政單位，由明朝的布政使改為巡撫，相當於今天的省長。府相當於地級市，直隸州相當於省轄市，直隸廳則主要出現在少數民族聚居地區。縣則是基層行政單位，大體相當於今天的縣。
清朝還設有特殊的行政單位，如盟和旗，這些單位主要分布在東北地區和邊疆地區，如蒙古、西藏和新疆等地。在這些地區，清朝實行了不同的行政制度，如「旗盟制」、「札薩克制」、「駐藏大臣」制度和伯克制等，以適應當地的民族和文化特點。
至光緒三十四年（1908年），清朝的行政區劃包括二十二個省份以及內蒙古、外蒙古、青海等邊疆地方。這些省份包括直隸省、山西省、山東省、河南省、江蘇省、安徽省、浙江省、江西省、福建省、廣東省、廣西省、湖南省、湖北省、雲南省、貴州省、四川省、陝西省、甘肅省、台灣省（1887年建省）等。
在地方行政系統上，清朝政府採用三級行政區劃系統，全國以省-府/直隸州-縣三級制為主。此外，還增加了廳（直隸廳相當於府，散廳相當於縣）、盟（相當於府）、旗（相當於縣）等行政單位。清朝時，散州和散廳不再領縣，僅相當於是縣換了個名稱。清朝的一級行政區劃包括直隸省、奉天省、吉林省、黑龍江省、伊犁將軍轄區、西寧辦事大臣轄區、駐藏辦事大臣轄區、內札薩克蒙古地方等。