火山圖(Volcano Plot)是一種常用於展示基因表達、蛋白質組學或其他高通量數據分析結果的圖形。它有助於快速識別那些在統計上顯著變化且變化幅度較大的數據點。解讀火山圖時,可以關注以下幾個方面:
座標軸:
橫軸通常表示變化倍數(Fold Change),以log2轉換後的值展示,點越偏離中心,表示差異倍數越大。
縱軸表示顯著性水平,通常是-log10轉換後的P值(adjusted P-value),點越靠圖的頂部,表示差異越顯著。
點:
圖中的每個點代表一箇檢測到的基因、蛋白質或其他分子。
點的顏色、大小和形狀可能代表不同的屬性,如上調、下調或無顯著差異,這些通常會在圖例中說明。
閾值線:
火山圖中通常會有兩條或更多的閾值線,用於篩選出在統計上顯著且變化幅度較大的數據點。
橫軸上的閾值線表示變化倍數的閾值,如Fold Change > 2或< 0.5。
縱軸上的閾值線表示顯著性水平的閾值,如adjusted P-value < 0.05。
關注區域:
位於火山圖右上角的點表示顯著上調的數據點。
位於左下角的點表示顯著下調的數據點。
位於中間區域的點表示變化不顯著或變化幅度較小的數據點。
綜上所述,通過關注火山圖的座標軸、點、閾值線和關注區域,可以直觀地瞭解哪些數據點在統計上顯著且變化幅度較大,從而有助於進一步的分析和驗證。需要注意的是,不同研究或文章中火山圖的繪製和解讀可能略有差異,因此最好結合具體的文獻或研究背景進行解讀。