《火影忍者》的副本攻略主要包括以下幾個方面：
副本類型。普通副本用於獲取經驗值、銅幣等基礎獎勵，而修羅副本則額外提供修天賦頁，用於提升戰鬥力。精英副本專注於掃蕩人物碎片，每天可進行三次，有機會獲得角色碎片。
戰鬥技巧。例如聚怪技巧，即在怪物逐漸出現的過程中，繞到一批怪物的聚集地，一起消滅，以節省時間和體力。保持技能和普攻的連貫性，儘量不漏怪，也是提升效率的關鍵。
副本進入和獎勵。副本進入有等級、組隊條件等限制，並且每天有進入次數限制。部分副本地圖進入需要消耗體力值。玩家在限定時間內消滅敵人後，可以獲得銅幣、經驗值、天地捲軸等獎勵。
特殊副本。如百鍊忍傳副本，要求玩家等級達到50級以上，進入時需要消耗500精華，不支持組隊。通關後可獲得下一章節開啟的獎勵和閱歷值。
戰力提升。遊戲中的戰鬥力是重要的基礎，可以通過收集忍者、忍者升星、裝備升級進階等方式提升。其中，將忍者升至滿星會按百分比增加戰力，是提升戰力的重要手段。
此外，玩家應合理使用遊戲內的資源和系統，如組織功能、好友功能等，以提升遊戲體驗和戰鬥力。