虛構的忍者世界
《火影忍者》的故事背景是一箇虛構的忍者世界，主要圍繞火之國木葉隱村展開。故事的主角鳴人是第四代火影波風水門和漩渦玖辛奈之子，同時也是六道仙人次子阿修羅的查克拉轉世者。鳴人在出生時，父母爲了保護村子而犧牲，並將尾獸“九尾”封印在他體內，使他成爲孤兒。鳴人從小受到村民的歧視，但在老師海野伊魯卡和第三代火影猿飛日斬的鼓勵下，他有了成爲火影的夢想，並努力獲得人們的認可。
故事中還涉及到了忍者世界的起源，包括神樹和輝夜姬的降臨，以及大筒木一族的故事。輝夜姬是第一個擁有查克拉的女人，她利用自己的超能力導致了戰爭，並最終開啓了無限月讀。輝夜姬救下了一部分人類，並創造了兩個兒子，大筒木羽衣和大筒木羽村。輝夜姬教導人們神樹滋養了大地，需要定期供奉，即選擇少男少女作爲祭品。最終，大筒木羽衣和羽村揭露了供奉的祕密，並與輝夜姬發生了衝突。
在戰國時代，忍者以部落形式生活，每個部落的忍者通常屬於一箇家族，如千手一族、宇智波一族等。這些部落的忍者受僱於五大國，相當於僱傭兵或軍事力量。戰國時代的忍者衝突主要是族與族之間的衝突，其中千手和宇智波是實力最強的兩個族。