方程這個名字的由來可以追溯到中國古代的數學著作《九章算術》。
在《九章算術》中，「方程」指的是一次方程組。這裡的「方」意味著並列，「程」則指的是用算籌來表示豎式的方法，即通過布置算籌來解方程組。這種表示方式類似於現代的矩陣形式，使得幾個未知數的係數排列成方陣，因此得名「方程」。這種解法在歷史上非常先進，比歐洲使用字母表示未知數和解一元一次方程組的方法早了1500多年。
隨著時間的推移，「方程」這個詞被廣泛用於表示含有未知數的等式，這類等式用於表示兩個數學式（如數、函式、量、運算）之間的相等關係。使等式成立的未知數的值被稱為「解」或「根」，而求方程的解的過程稱為「解方程」。