珍珠奶茶的製作可以分為製作珍珠和製作奶茶兩個主要步驟，以下是詳細的製作過程：
製作珍珠。將水和糖（可以使用紅糖或黑糖）煮沸，然後熄火，迅速倒入木薯澱粉中，用筷子快速攪拌以形成麵團。將麵團揉成條狀，切成小段，然後搓成小圓球，為了防止粘連，可以在木薯澱粉上滾動。在另一鍋中燒開水，將珍珠煮約20分鐘，煮好後用冷水沖洗，以使珍珠更有彈性。
製作奶茶。將紅茶（或普洱茶）和水煮沸，然後加入糖，炒至金黃色，倒入牛奶，加熱至微沸，然後熄火，過濾掉茶葉。將煮好的珍珠放入杯中，倒入奶茶即可。
此外，可以根據個人喜好添加不同的調味品，如蜂蜜、糖漿等，以調整口味。