製作生物筆記時，可以採用閱讀筆記、聽講筆記和觀察筆記三種方法。具體如下：
閱讀筆記。可以在閱讀時製作抄寫筆記，包括全抄和摘抄，需要注意抄寫後校對以避免錯誤，並標明出處以便日後查考；製作卡片筆記，卡片內容應根據個人需求而定，但應包括資料類別、編號、出處、著者姓名和正文等，每張卡片寫一箇內容並及時進行分類歸檔或裝訂成冊；製作批語筆記，即在書頁空白處記下對原文的個人意見和心得體會；製作符號筆記，即在原文中標註符號以加深理解，如黑點、圓圈、直線等，但需注意符號意義必須明確且貫徹始終，避免過多過密的符號；製作概要筆記，即用自己語言概括某本書或文章的重點內容。
聽講筆記。課堂聽課或聽報告、講座時，需要記的重點包括疑難問題、書上沒有的信息，而對於次要問題、易懂之點、書上已有的內容則不必記錄，可以使用提綱式筆記，即以大綱形式記錄主要信息。
觀察筆記。在生物課內外對生物形態和生命現象進行觀察時，需要詳細記錄觀察過程和結果，特別注意細節、前後比較和過程變化，以抓住生物特徵。
此外，還可以利用目錄、章節梳理、思維導圖等輔助工具來增強筆記的系統性和易理解性。