生物萃取方法主要包括以下幾種：
水蒸汽蒸餾法。這種方法設備簡單，適用於易與水分離的成分提取。但缺點是在提取過程中，一些熱不穩定成分如多糖可能會被破壞，揮髮油也可能與水發生反應導致變味。
超音波輔助法。此方法提取溫度低、耗能低，適合提取極性和熱不穩定性組分。但目前的超聲儀容量不適合工業化生產。
超臨界CO2萃取法。這種方法可以有效防止熱敏性物質氧化和逸散，提取後的原料可用於其他用途，但投資費用高，對安全要求嚴格。
酶解法。這是一種溫和的低溫提取方法，反應速度快，雜質易去除。但成本較高，對設備和技術要求也高。
液-液萃取。利用物質在兩個互不相溶的液相中分配特性的差異進行分離。
生物萃取方法。例如將水提液樣品加入含有合適生物的培養基中，通過生物代謝提取親脂性成分。
這些方法各有優缺點，適用於不同類型的化合物和不同的提取需求。選擇合適的方法需要考慮目標化合物的性質、成本、設備可行性以及安全性等因素。