番石榴樹的修剪是非常重要的，可以控制樹冠大小、保持光線透過性、增加花期和果實質量，從而提高產量。番石榴的修剪可以根據季節進行，一般在3-4月發芽開始生長，所以最好在5-6月間進行修剪，因為這個時候番石榴的生長活躍，修剪後能夠快速恢復。
修剪的部位主要包括主幹、側枝和頂枝。首先修剪主幹，剪去生長勢頭不旺，不結花不結果的主幹；其次修剪側枝，保留生長勢頭好的側枝，將垂直於主幹的細弱側枝全部剪掉；最後修剪頂枝，儘量保持偏下的枝條，大的枝條要逐步退下，留下三根左右的嫩枝。
修剪的方法需要根據不同的部位採用不同的方式。對於主幹，需要使用鋸子進行砍削；對於側枝和頂枝，需要使用剪刀進行精細修剪，確保切口平滑，不留殘留物。
其他注意事項包括：
剪枝後要及時清理落葉、落枝和殘渣等；
在種植過程中要避免施肥過多，以防止過多的營養分降低開花速率；
保持充足的透氣性，通風條件良好，可有效防止疾病和蟲害的發生。
春季修剪是番石榴樹一年中最重要的一次修剪，一般在春季果實採收完畢後或果樹休眠將甦醒時進行。夏季修剪、秋季修剪和冬季修剪也有各自的特性和注意事項。