番茄病害主要可以分爲以下幾類：
病毒病害。包括菸草花葉病毒（ToMV）、黃瓜花葉病毒（CMV）、番茄黃化曲葉病毒（TYLCV）等，症狀可能包括花葉、黃化、捲曲等，防治方法包括選用乾淨種子、控制蟲害（如蚜蟲）和土壤消毒。
細菌病害。如軟腐病、黑斑病、青枯病等，症狀包括植物傷口處的腐爛、葉片上的小斑點等，防治方法包括抗病性品種的選擇、土壤消毒和適當的農事操作。
真菌病害。如晚疫病、早疫病、灰葉斑病、葉黴病、灰黴病等，症狀包括葉片上的病斑、果實軟化等，防治方法包括使用廣譜殺菌劑和加強田間管理。
生理障礙（非侵染性病害）。如筋腐果、臍腐病、黃葉等，這些病害由環境因素如溫度、水分、營養不足等引起，需要通過改善環境條件和管理來防治。
此外，還有根結線蟲病等，由根結線蟲引起，主要危害根部，可以通過選擇抗病品種和土壤消毒來防治。