正畸後需要注意的問題包括：
牙齒齲壞。由於牙齒粘接托槽的周圍容易滯留食物，不易及時清除，可能導致牙齒齲壞。
牙齦問題。如果口腔衛生不佳，牙齒周圍有食物殘渣或軟垢堆積，可能引發牙齦炎，表現為刷牙或吃東西時出血，牙齦周圍紅腫。
牙齒鬆動和牙根吸收。由於牙齒在新位置上尚未達到動力平衡，肌肉平衡尚未建立，如果施加在牙齒上的力量過大，可能造成牙齒鬆動和不同程度的牙根吸收。
為預防這些問題，建議在正畸過程中使用正畸牙刷徹底清除牙基，避免食物殘留在托槽周圍。還應每半年到一年進行牙齦潔治，以避免菌斑和牙垢的增生，防止對牙齦乃至牙槽骨的損害。