瘤尾守宮的性別可以通過多種方法進行區分。首先，成體的瘤尾守宮在體型上就有很大的區別，母體的體型比公體要大的多。其次，雄性瘤尾守宮有一個類似哺乳動物的陰囊的凸起，這種凸起在雌性瘤尾守宮身上多少也會有，但形狀較小。此外，雄性瘤尾守宮長有發達的泄殖腔刺，表現為位於泄殖腔兩側3-4個圓錐堆，每個圓錐堆上有4-5個腔刺，體型是圓錐堆周圍刺狀疙瘩的兩倍大小。而雌性瘤尾守宮在泄殖腔兩側有1-2個圓錐堆物體，上面的腔刺和周圍刺狀疙瘩的大小差不多。因此，通過觀察體型、陰囊的形狀和泄殖腔刺的特徵，可以有效地區分瘤尾守宮的性別。