相對丰度的計算通常涉及以下幾個步驟:
確定樣本中每個物種的絕對數量:這可以通過DNA序列的數量等方式來實現。
計算特定物種在樣本中的絕對數量佔所有物種絕對數量總和的比例:這個比例通常表示爲百分比,即該物種在該樣本中的相對丰度。
不跨樣本比較:相對丰度的計算應該是樣本內部的,即每個樣本獨立計算自己的相對丰度,不應將一箇樣本中的物種數量與所有樣本的總數量相比較來計算相對丰度,因爲這樣會混淆不同樣本間的微生物組成差異。
樣本間比較:如果需要比較不同樣本中的相對丰度,可以使用上述方法分別計算每個樣本的相對丰度,然後進行比較。
以上步驟可以幫助正確計算單個樣本中的相對丰度,以及不同樣本之間的相對丰度差異。