神父和牧師主要的區別在於他們所服務的宗教和教會不同，以及他們的職責和地位也有所不同。
神父通常指的是天主教或東正教中的神職人員，他們在教會中負責主持彌撒、授予聖事、佈道、婚禮、告解等宗教儀式，並指導信徒的靈性成長。根據不同的教規，神父可以結婚或保持獨身。牧師則是一箇更廣泛使用的術語，通常指新教中的神職人員，他們爲教會內的信徒提供精神上的指導、主持禮拜和聖餐等儀式，並管理教會的日常事務。與神父不同，新教的牧師通常可以結婚並有家庭。
在歷史和宗教改革背景下，神父和牧師分別屬於不同的基督教派別。神父主要出現在天主教和東正教中，而牧師則更多見於新教。這些差異反映了基督教歷史上的分裂和不同教派的神職人員角色定位。