《神魔之塔》黃道十二宮故事為:
1. 牡羊座,惡魔腕錶的破裂,將星之塔內魔物變得狂暴。而你的任務是喚醒十二星座的守護者與他們匹配,共同守護星之塔。
2. 金牛座,是可攻略角色之一,幫助玩家獲得新的鑰匙卡——天秤鑰匙。
3. 雙子座,協助七煌寶石完成十二星座的覺醒。
4. 巨蟹座,與星之塔的BOSS展開戰鬥。
5. 獅子座,可以增加塔內的小怪的難度。
6. 處女座,在星之塔內阻止邪惡勢力,保護人類的尊嚴。
7. 天秤座,天秤鑰匙卡擁有強大的能力,守護者與惡魔的平衡之力。
8. 天蠍座,需要與守護者建立契約,提高守護者的能力。
9. 射手座,將惡魔腕錶的指針停止在正確的時間,需要和射手座進行協戰。
10. 摩羯座,需要在寒冷的冰霜之中尋找到守護者的契約。
11. 水瓶座,打敗入侵星之塔的邪惡勢力。
12. 雙魚座,任務是尋找到七煌寶石以揭示他們被掩蓋的真相。
此外,《神魔之塔》還設定了多個小故事情節,如通關後的獎勵、妖怪和戰鬥玩家角色的友好度、大魔物劇情獎勵等。