科學研究中常用的方法包括：
觀察法。直接用肉眼或藉助放大鏡、顯微鏡等儀器進行觀察。科學觀察要有明確的目的，觀察時要全面、細緻和實事求是。
實驗法。利用特定的材料和器具通過有目的、有步驟的操作、觀察、記錄和分析，發現或驗證科學結論。
調查法。包括普查法和抽查法，通過收集和分析資料來研究。
文獻調查法。通過查閱和分析文獻資料來進行研究。
系統方法。將研究對象視爲系統，研究其元素、結構、功能等。
數學方法。利用數學理論和分析方法進行研究。
信息論方法。利用信息理論來處理和分析數據。
控制論方法。通過控制和操縱研究對象來研究其行爲。
實證研究法。通過實際觀察和實驗來驗證理論。
定量分析法。運用數學工具進行精確的測量和分析。
這些方法根據研究的性質和目的可以選擇使用，有時也可以結合使用多種方法以達到更好的研究效果。