紫水晶的處理方法主要包括清潔、保養和打磨。
清潔：首先，使用清潔水均勻噴灑在紫水晶表面，然後用羊毛刷刷洗乾淨，再用衛生紙擦淨。
保養：使用白茶油噴灑在麂皮布上，再均勻塗抹到紫水晶表面，塗抹不到的地方可以使用豬鬃刷刷塗均勻。如果覺得塗抹過多油感厚重，可以使用衛生紙輕輕擦拭，使保養油薄薄的一層附在紫水晶表面，使其更有質感，然後放到陰暗的環境下密封保存。
打磨：首先，把胚形衝好，然後把磨盤換成拋光盤，給寶石的檯面進行拋光。然後，打磨冠部，拋光亭部，最後給寶石加磨砂面，使其更有層次感，看起來更漂亮。
需要注意的是，紫水晶的處理還包括一些不常見的方法，如酸洗和染色、熱處理、輻照、拼合以及充填和覆膜等，這些方法在高端紫水晶中不常見，但仍需警惕。