要辨別紫玉髓的真假，可以採取以下幾種方法：
測硬度。紫玉髓的莫氏硬度約為6.5，可以用低於這一硬度的器具刻劃其表面，真正的紫玉髓不會留下痕跡。
掂比重。真正的紫玉髓手串手感沉重，因為其礦物密度為2.63g/cm³，而假的則顯得輕飄。
看成色。真正的紫玉髓可能會有一些小瑕疵，但整體顏色不會過於單一或均勻，不會有太多的深淺變化或幾乎沒有雜質。
觀察光澤。真正的紫玉髓無論半透明或不透明，都有溫潤的光澤，可能含有少量雜質或呈棉絮狀花紋。假的紫玉髓色澤乾枯、灰暗，有的還有氣泡。
聽聲音。將紫玉髓掛起，用硬物敲擊，真正的紫玉髓聲音清脆悅耳，餘韻悠揚；假的則相對沉悶乾澀。
觀察透光性。真正的紫玉髓紋理不一，不會有兩顆完全相同的紫玉髓。合成的紫玉髓通常顏色偏紫，不透明，缺乏天然的感覺。
此外，要警惕價格過低的紫玉髓，真正的紫玉髓不太可能非常便宜。紫玉髓和紫翡翠雖然外觀相似，但紫玉髓實際上是石英，永遠達不到翡翠的品質。一些假冒的「冰種紫羅蘭」實際上是紫玉髓偽裝成的翡翠，可以通過比較種水和顏色的差異來識別。