總督和巡撫在清朝時期是地方高級官員，但它們之間存在幾個主要區別：
品級不同：
總督通常是正二品官銜，而巡撫則是從二品官銜。總督有時會兼任尚書銜，成為從一品，而巡撫則可能兼任侍郎銜，成為正二品。
管轄範圍不同：
總督通常管理一個或多個省份，而巡撫則只管理一個省份。總督的管轄範圍更廣，可能涉及多個省份的軍政民大權。
權力與職責不同：
總督的權力通常比巡撫大，側重於軍事，而巡撫則側重於民政。兩者在權力上互相制衡，但都直接聽命於皇帝。
官職性質不同：
總督和巡撫雖然都是地方高級官員，但它們並不完全等同於現代的地方官職。在清朝，總督和巡撫帶有派出性質，這是清統治者加強中央集權的需要。
數量與設定：
清朝共有九大總督，而巡撫的數量則與行省的數量有直接關係。總督的數量相對較少，但每個總督管理的區域通常比巡撫廣泛。
綜上所述，總督在品級、管轄範圍、權力和官職性質上都高於巡撫，而巡撫則主要負責一個省的日常行政事務。兩者雖然都是地方高級官員，但在職責和權力上有所區別，共同構成了清朝地方行政體系的重要組成部分。