繩文人是日本列島最早的居民之一，他們的特徵主要體現在以下幾個方面：
體型方面。成年男性平均身高約160厘米，成年女性約150厘米。
面部特徵方面。面部輪廓清晰，眉間（前額中央）突出，鼻根凹陷，眉毛濃重，眼睛較大，雙眼皮，嘴唇稍厚，顎骨發達。
膚色方面。一般被描述為較黑。
藝術方面。他們製作的陶器具有獨特的繩紋裝飾，這也是繩文時代名稱的由來。
居住方式方面。他們主要依賴狩獵和採集為生，居住在半地下式的房屋中，即豎穴式住居。
遷移方面。繩文人大約從3.8萬年至1.8萬年前從亞洲大陸遷移到日本。
基因方面。他們的Y染色體標記為D1b，母系線粒體為n9b，這些特徵在今天的日本阿伊努人中仍然可見。
社會結構方面。繩文社會可能是以氏族為基礎的，相對平等，沒有明顯的社會階級差異。
此外，有研究提出繩文人可能與現代日本人有一定程度的遺傳聯繫，尤其是Y-DNA單倍型，約四成的日本人的Y-DNA單倍型都來自繩文人。