清洗羊肚菌的方法根據其類型（新鮮或乾燥）而有所不同。以下是詳細介紹：
新鮮羊肚菌。新鮮羊肚菌不需要泡發，可以直接用清水沖洗。將羊肚菌放入盆中，用手輕輕打圈清洗，重複2到3次，直到洗淨。有的方法建議使用45到50度的溫水進行清洗，有助於釋放羊肚菌的香味同時保持其口感。
乾燥羊肚菌。乾燥羊肚菌應先用冷水沖洗表面，以去除灰塵和雜質。然後用45度左右的溫水浸泡20到30分鐘，直到羊肚菌變軟，水變成酒紅色。浸泡後，應將其撈出並用清水沖洗乾淨。注意，泡發時不宜使用開水或直接冷水，且不應擠壓羊肚菌，以免香味和營養流失。
無論哪種類型，清洗羊肚菌時都應注意不要過度用力，以免損壞其質地。清洗後，應將羊肚菌放在乾淨的毛巾或廚房紙上瀝乾水分。