肥料利用率低的原因主要包括以下幾點：
土壤質量不佳。如土壤酸性或鹽鹼化，導致養分流失快，降低肥料吸收程度。
施肥不合理。包括過量施肥、頻繁施肥、不同類型的肥料混用，以及施肥時機和方法不正確。
氣候條件不利。如低溫、高濕度、自然災害等，影響作物對肥料的吸收能力。
土地退化。長期過度使用化肥和農藥導致土壤貧瘠和退化，損害農田生物多樣性和水土保持能力。
肥料種類不適。不同植物和土壤類型需要特定種類的肥料，不適配的肥料種類會導致浪費。
施肥不均衡。肥料過度集中在農作物某些區域或時間段，導致浪費。
缺乏科學施肥技術和有效管理手段。導致農民不能準確控制施肥量和時間。
肥料質量問題。包括欺詐性和劣質肥料，對植物生長不利，導致土地退化和植物死亡。
土壤酸鹼度不合適。影響作物對肥料的吸收利用。
施肥量過大。導致作物養分過剩，營養物質流入環境，造成資源浪費。