腐植酸鈉的作用主要體現在以下幾個方面：
收斂、止血、止瀉：腐植酸鈉具有收斂止血、止瀉的作用，對應的症候群有吐血、便血、泄瀉、嘔吐、脘腹疼痛、脾虛久瀉、久痢等。
鎮靜催眠、止痛作用：腐植酸鈉可以抑制交感神經，起到一定的鎮靜催眠、止痛作用。
消炎、抗病毒作用：腐植酸鈉可以收縮血管，降低毛細血管滲透性，起到消炎、止血作用，同時還具有抗病毒作用。
促進傷口癒合：腐植酸鈉還可以促進傷口的癒合。
提高機體的免疫力：腐植酸鈉可以增強免疫力。
吸附作用：腐植酸鈉還有吸附的作用，可以保護胃黏膜，提高黏膜細胞層的質量，對幽門螺桿菌也有一定的作用。
此外，腐植酸鈉在水產養殖中還有以下作用：
降解水體綜合毒素，有效吸附和分解氨、氮、硫化氫、亞硝酸鹽等有害物質。
解除由重金屬離子、有機農藥等導致的中毒症狀，有效解除藻毒素，預防施用殺蟲、殺菌劑後藻類大量死亡而引起的藻毒素中毒。
防止池塘老化，消除水面的有機物泡沫，平衡pH值，穩定水生態環境。
緩解赤潮和水華產生，降解氨氮、亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質，增加水體溶解氧，改善水質和底質。