自製食用酵素的方法主要包括以下幾個步驟：
準備工作：首先，需要對刀具、菜板和容器進行消毒，可以使用開水燙過的方法。
原料處理：將水果清洗乾淨，去皮去核後切成適當大小的塊狀。
配比：一般採用紅糖（或蜂蜜）：水果：水=1：3：1的比例進行混合。如果是使用白砂糖，可以按照水果2斤半，白砂糖1斤半，純淨水6升的比例進行配製。
發酵：將混合好的原料放入容器中，容器應留有一定的空間以供發酵。蓋子上的通氣孔可以打開，留出一些縫隙以便氣體流出。
放置環境：發酵期間，酵素可以放在室內，但應避免放置在冷氣房內或暴曬在陽光下。
發酵時間：發酵時間至少為6個月，期間需要定期檢查產氣變化，並在第一個月每天搖動罐子並打開蓋子以釋放氣體。如果是使用快速發酵桶，夏天一般3天左右就可以完成發酵。
食用方法：食用時，可以將酵素液體過濾倒入另一個瓶子中。飯前喝10cc酵素，加入200cc的水。身體虛弱或有嚴重疾病的人，每次只能食用一滴酵素加入200cc的水。小孩的份量也是一滴酵素加入200cc的水。飯後半小時食用，用量根據個人口味用溫水稀釋，推薦比例酵素：水=1：2（可加蜂蜜調味）。
食用酵素的功效包括促進消化、促進代謝、改善腸道微生態環境等。在製作過程中，應注意衛生和安全，確保原料的新鮮和適宜性。