芒果流膠的原因主要是由於芒果植株受到病原菌的感染，如擬莖點霉或色二孢霉，這些病原菌會導致芒果枝條、莖幹和幼果發病，患部出現條狀潰瘍，中部稍下陷，滲出淚痕狀帶反光性的粘液，初無色，後呈褐色。此外，還有細菌性角斑病等細菌性病害，也會導致枝條和果實感染，使得感病部位突起裂開，並有菌膿滲出。
芒果流膠的病原為擬莖點霉(學名:Phomopsis mangiferae)和色二孢霉(學名:Diplodia mangiferae)，這兩種病原菌分別引起擬莖點霉流膠病和梢枯流膠病。擬莖點霉流膠病會導致芒果葉片產生不規則的黑色病斑，後期呈灰白色，上面有許多小黑點（分生孢子器），莖桿感病時，表皮組織變色，粗糙開裂，流出棕褐色的樹脂，表層、韌皮部及木質部變黑壞死。梢枯流膠病則會導致莖或枝條感染後，皮層壞死而出現潰瘍斑，流出白色後轉為褐色的樹膠，病部以上的枝條枯死。
芒果流膠病的防治方法包括改善栽培條件，做好抗旱工作，增加肥水管理；在新建果園中儘量少選用易染病的苗木作砧木。發病後還可以採取噴灑藥劑防治、刮治和塗藥。