芒果黑線通常是由於芒果存放時間過長，導致果肉被氧化，原有的纖維素被破壞，這種情況主要發生在芒果被儲存了較長時間後，果肉中的纖維素發生氧化，使得原本的纖維素被破壞，這種變化不僅影響芒果的外觀和口感，還可能使果肉中的營養成分受損。
此外，芒果黑線也可能是由於芒果開始繁殖，果核發芽，導致果肉開始木質化並長出黑色的絮狀物。在這種情況下，果肉不僅外觀不佳，而且味道可能寡淡甚至帶苦味，還可能含有細菌等有害微生物，因此不建議食用。
需要注意的是，芒果表面的黑點是由於運輸或存儲時受到擠壓，表面形成的黑色點點，這是芒果外表的褐變情況，與果肉里的黑線不同。如果芒果皮上的黑點不深入果肉，裡面的果肉完好，這樣的芒果仍然可以食用。