莫三比克擁有多個港口，主要港口包括：
馬普托港（Maputo）。位於該國南端，是莫三比克的首都和主要港口，瀕臨印度洋馬普托灣，是東非的主要港口之一，對全國貿易和經濟至關重要。
貝拉港（Beira）。位於莫三比克中部，是該國第二大港口，主要用於出口煤炭和鋁礦，擁有現代化設施和航道，方便大型貨船進出。
納卡拉港（Nacala）。位於莫三比克北部，是該國較小但重要的港口之一，主要用於出口木材和農產品。
彭巴港（Pemba）。位於莫三比克東北沿海，是該國的天然良港，隱蔽且易於進入，寬8公里，長13公里，港口入口寬2.4公里，最窄處為1.85公里，水深從73.16米至109.74米。
此外，莫三比克的其他重要港口還包括伊尼揚巴內（Inhambane）、克利馬內（Quelimane）等。這些港口共同支撐著莫桑比比的貿易和經濟活動，特別是在與內陸國家如尚比亞、馬拉威和辛巴威的貿易中發揮著關鍵作用。