菌肥是一種環保高效的肥料，其施用方法多樣，主要包括：
均勻撒施。將菌肥均勻撒在土壤表面，然後輕輕覆蓋一層土壤，或與土壤充分混合，以確保菌肥與植物根系有效接觸。
提前施用。在農作物生長前期施用菌肥，以便與土壤中的有益微生物建立共生關係。
適量施用。根據土壤狀況和農作物需求確定施用量，每畝施用50~100公斤菌肥為宜。
拌種。將菌肥與清水混合後塗抹在種子上或與種子混合，為種子提供營養。
基肥或追肥。作為基肥，將菌肥與有機肥料混合後施入土壤中；作為追肥，將菌肥與清水混合後澆灌土壤。
注意水分管理。保持土壤濕潤，有利於菌肥中的微生物繁殖。
避免直接接觸植物葉片或莖部。以免對植物造成損害。
避免與農藥同時使用。因為某些農藥可能影響菌肥中的微生物。
此外，還需要考慮土壤的pH值和溫度，一般適宜溫度為25至37攝氏度，pH值在6.5至7.5之間。每種作物和土壤類型可能最適合特定的菌肥施用方法，因此建議根據具體情況調整施用策略。