菌菇水的正確使用方法主要包括以下幾種：
濕敷。首先清潔肌膚，確保肌膚上的灰塵和油脂被完全清理乾淨。然後取一片薄的化妝棉，倒上適量的菌菇水，對肌膚進行濕敷，濕敷的時間一般為5至10分鐘。濕敷後，記得用清水將臉部洗淨，以避免營養過剩，這可能導致皮膚問題如爆痘或閉口。
輕拍於臉部。每日早晚潔膚後，可以使用化妝棉或指腹蘸取適量菌菇水輕拍於臉部，避開眼唇部位。這種方式適合任何膚質，包括敏感肌膚，可以幫助改善肌膚問題如過敏、長痘、紅血絲等。
作為面膜使用。在肌膚適應菌菇水後，還可以將其作為面膜使用。先用清潔肌膚，然後用菌菇水浸泡麵膜紙，敷在臉上10分鐘，同樣是每兩三天使用一次。
使用時需注意，菌菇水中含有一些功效較強的成分如靈芝、白樺茸等，因此不建議頻繁使用。開始使用時，應給肌膚一段時間適應，之後可根據肌膚狀況增加使用頻次。