菌落是指由單個或少數微生物細胞在固體培養基表面或內部生長繁殖到一定程度，形成的一團肉眼可見的、有一定形態和構造特徵的子細胞集團。菌落特徵主要包括大小、形狀、邊緣、表面性狀、隆起度、顏色及透明度、硬度與溶血性等。
細菌菌落的特徵通常是較小的，表面可能光滑粘稠或粗糙乾燥，多為白色或黃色，形狀圓形，邊緣整齊。黴菌菌落則通常比細菌菌落大幾倍到幾十倍，呈絨毛狀、絮狀或蜘蛛網狀，可能有紅色、褐色、綠色、黑色等顏色。真菌菌落也屬於黴菌菌落，一般比細菌菌落大幾倍或幾十倍。
此外，菌落特徵還包括其隆起度、硬度等。例如，有的菌落中央隆起，有的則陷凹；有的菌落黏液狀或膜狀，有的則乾燥或濕潤。