萬曆三大怪指的是明代萬曆皇帝時期的三大奇特現象，具體包括：
外貿發達，國庫空虛：儘管明朝的外貿非常發達，每年有大量的白銀流入，但明朝的國庫卻一直處於空虛狀態。這是因為走私泛濫，官商勾結，導致大量稅收流失。即使在外貿繁榮的廣州，老實納稅的商人也會受到官府的盤剝，而走私船舶只要支付足夠的「保護費」，就能合法化地賺取巨額利潤。這種現象導致了國家財政的嚴重困難。
萬曆三大奇案：包括偽楚王案、妖書案和梃擊案。這些案件的發生背景複雜，涉及宮廷內部的權力鬥爭和政治陰謀，如妖書案中，一篇名為《憂危竑議》的匿名小冊子在京城廣泛傳播，引發了朝臣對鄭貴妃及其家族的猜疑和彈劾，最終導致多名官員被貶謫。
奇葩奏摺泛濫：在萬曆皇帝怠政的時期，官員們寫的奏摺出現了許多奇怪的現象。這些奏摺往往內容冗長，廢話連篇，與明朝初期嚴格格式的奏摺相比，顯得非常奇特。這種現象反映了當時官場的風氣已經發生了變化，官員們不再嚴格遵守規定的格式和要求。
綜上所述，萬曆三大怪反映了萬曆皇帝時期的政治、經濟和社會風氣的複雜性和多樣性。這些奇特現象不僅在當時引起了廣泛的關注和討論，也對後世的歷史產生了深遠的影響。