蕨菜的保存方法有多種，可以根據需要選擇合適的方法：
煮熟後密封保存。先將蕨菜洗淨，用低溫煮熟，然後加入純淨水裝袋，進行密封保存，這樣可以保持新鮮度，且在適當條件下可數月不變質。
真空保存。將蕨菜裝入可密封的保鮮袋中，抽出袋內空氣，創造真空環境，這樣處理後的蕨菜在3到5個月內不會變質，若再放入冰櫃冷藏，可進一步延長保鮮期。
曬乾保存。將蕨菜曬乾後存放在乾燥陰涼的環境中，風乾後的蕨菜可保存數年不變質，食用前用清水泡軟即可。
醃製保存。使用鹽醃製蕨菜，按七份菜三份鹽的比例操作，醃製後去除表面鹽分，用氯化鈣溶液浸泡約20分鐘，進行殺菌處理後裝袋密封保存，這樣可以保持新鮮度，大約6到8個月內不會變質。
去苦味後冷凍。先去除蕨菜的苦味，通過煮沸和用烘烤紙覆蓋的方法來減少苦味，然後分裝成適合一次食用的量，用保鮮袋或保鮮盒裝起後放入冰櫃冷凍保存，可以保持一年不變質。
製作酸蕨菜。將處理好的蕨菜放入鹽水中焯煮後裝入玻璃罐中，確保蕨菜完全浸泡在鹽水中，然後放在陰涼通風的地方，一周後即可食用。