區分蜥蜴的性別可以通過多種方法，具體方法取決於蜥蜴的種類。以下是一些常見的辨別方法：
觀察尾巴和腹部特徵。一般來說，雄性蜥蜴的尾巴較長且粗，腹部較窄，腿較長；雌性蜥蜴的尾巴較短且細，腹部較寬且圓，腳較短。
觀察體色。雄性蜥蜴通常比雌性擁有更亮麗鮮艷的體色；雌性蜥蜴的體色通常較為灰暗。
檢查生殖器官。觀察蜥蜴的生殖器官，雄性的生殖孔較小且圓，擠壓時可能會有突出狀物；雌性的生殖孔較大且扁平，擠壓時無突出物。
觀察股孔。某些品種的蜥蜴，特別是在成熟個體中，雄性的尾根部分因藏有睪丸等生殖系統而有兩個明顯的重大部分；雌性則平滑或只有一個凸起。
觀察頭部和眼睛大小。雄性通常有更大且更明亮的眼睛。
行為觀察。例如，藍舌石龍子中，雄性之間可能會互相排斥甚至打架，而雌性則會搖動尾巴。
不同品種的蜥蜴在性別特徵上可能有所不同，因此最準確的方法是結合多種特徵進行判斷，或者諮詢專業人士。