蝠鱝和鰩魚的區別如下：
科屬 。蝠鱝和鰩魚同屬於軟骨魚綱板鰓亞綱，但蝠鱝是燕魟目鱝科蝠鱝屬，而鰩魚是鰩形目鰩科鰩屬。由於從目就不一樣了，所以差異還是比較大的，可以看做兩種不同的魚類。
外觀 。蝠鱝的身體扁平，頭部較寬，兩側有胸鰭分化而來的兩個頭鰭，胸鰭肥厚如翼狀，尾巴細長，如鞭子一般；鰩魚的身體呈圓形或棱形，胸鰭很寬，從吻端擴伸到尾部，尾巴壯實，整體看起來較圓潤。
生活習性 。蝠鱝主要生活在熱帶和亞熱帶的開闊海域，以浮游生物和小型魚類為食，而鰩魚主要生活在近海的底層水域，以底棲生物為食，如貝類、蝦類、蟹類等。
此外，蝠鱝和鰩魚在分布區域、繁殖方式等方面也存在區別。