貓咪剪耳的主要原因是爲了進行標記，表示這隻貓已經接受了絕育手術。這是世界動物保護組織所採用的一種區別流浪貓是否已絕育的方法，也是TNR流程中的一箇重要環節。以下是具體原因：
防止流浪貓過度繁殖。通過絕育手術可以有效控制流浪貓的數量，減少對環境的負擔，保護流浪貓的健康，避免母貓過度生育對身體造成損耗，防止貓咪長期發情引起的一些生殖疾病，如公貓泌尿問題，母貓子宮蓄膿，乳腺腫囊等。
標記已絕育的流浪貓。防止小貓咪被意外二次開膛破肚，因爲絕育後的貓咪的危害性會變得極低，這樣的情況下就能夠保持在一段穩定的流浪貓數量。
剪耳是在貓咪麻醉下進行的，創口小，出血量少，恢復快，不會對小貓咪的健康產生不好的影響。
剪耳是一種直觀的判斷方式，而且也不像項圈、耳標容易脫落或影響貓咪正常生活。
剪耳是最直觀的判斷方式，而且也不像項圈、耳標容易脫落或影響貓咪正常生活。
總的來說，剪耳是一種人道的手術方式，用以表明該野貓已絕育，同時也表明該野貓所依附的族羣受到了照管。