辣椒灰霉病的防治方法主要包括以下幾點：
加強通風降濕。保持苗床的漸乾漸濕環境，避免濕度過大。在濕度大的情況下，應注意放風，如打開上風口或下風口，以保持土壤乾燥和通風良好。
做好種子消毒。防止種子帶毒，同時注意防治蚜蟲、白粉虱、茶黃蟎等刺吸式害蟲，以切斷病毒病的傳播途徑。
藥物防治。發病初期，可以使用如嘉美紅利1000倍液+35%氟菌·戊唑醇SC 2000倍液或嘉美紅利1000倍液+50%啶醯菌胺WG 2000倍液等進行防治。
控制溫度和澆水。白天溫度控制在20~25度之間，避免超過28度，以促進辣椒苗健壯生長。同時，避免頻繁澆水，應根據土壤濕度情況適時澆水。
通過上述綜合措施，可以有效防治辣椒灰霉病。