在迷你地下城2中，玩家首先需要創建角色，每個角色都有不同的生命、法力、防禦和攻擊類型等屬性，玩家可以根據自己的喜好選擇角色，或者點擊隨機按鈕更換角色。
遊戲的基本操作是點擊地板上的空白區域進行移動，每次移動一格，攻擊距離也限制在身邊的四格之內，當有敵人進入攻擊範圍時，可以直接點擊它進行攻擊。戰鬥中需要運用走位技巧來獲得更好的輸出環境，例如利用障礙物卡位，只面對一個敵人的進攻。
完成一個區域的戰鬥後，可以返回村莊，在村莊中有三個NPC，分別是屬性強化NPC、武器商人和藥品及技能商人。在屬性強化NPC處，可以通過消耗榮譽點強化屬性，如生命值、法力值、攻擊力和防禦力。在武器商人處，可以購買各種武器裝備提升戰鬥力。右側的NPC處可以購買藥品和消耗性技能。通過強化和購買裝備，角色的實力可以得到顯著提升。
遊戲中還包含一些特定的技能，如禁錮、淨化、全螢幕閃電和旋風斬等。禁錮技能無論對於遠程武器還是魔法武器都非常有用，可以無傷擊殺怪物。淨化技能可以解除中毒或割裂狀態，使角色在戰鬥中保持最佳狀態。全螢幕閃電和旋風斬在前期非常有效，但在後期怪物的血量增加後，這些技能的傷害可能就不夠看了。
關於金幣的使用，初期可能需要通過無盡模式來積累金幣。隨著層數的增加，裝備的價值也會上升，因此越到後期，通過賣裝備獲得的金幣越多。在無盡模式中，當效率降低時，可能是時候放棄繼續挑戰了。