運費噸的計算方法取決於貨物的性質和運輸方式，具體如下：
根據貨物的重量計算。如果貨物重量較大，通常按每公噸、每長噸或每短噸計算，稱爲重量噸，用“W”表示。
根據貨物的體積計算。對於體積較大而重量較輕的貨物，通常按每立方米或每40立方英尺計算，稱爲尺碼噸，用“M”表示。
綜合考慮重量和體積。如果貨物的重量和體積比例不同，可能會按照重量噸或尺碼噸中的較大值來計算，即如果貨物重量大於1噸而體積不足1立方米，按重量噸計費；如果貨物體積大於1立方米而重量不足1噸，按體積即尺碼噸計費。
此外，對於整批貨物、零擔貨物、重箱或空箱以及包車運輸，運費計算方式會有所不同。因此，在計算運費時，還需要考慮具體的運輸類型和貨物的實際重量及體積。