金光明沙的使用方法主要包括以下幾個方面：
土葬。在未蓋棺前，將金光明沙撒於亡者額頭上；蓋棺後，撒於棺木上，使用膠水先抹於棺木上，再撒金光明沙；若已埋葬，則撒於墳墓之上，先以少量遍灑墳土，再估計額頭垂直位置，於其上方散灑金光明沙。
火葬。火葬前，將金光明沙撒於亡者額頭上；火化後，撿骨畢，裝入骨灰罈中，再撒一些於壇中。若骨灰罈已密封，可擠少許強力膠於骨灰罈蓋上，垂直撒下金光明沙。
其他用途。金光明沙也可用於除障、去病、放生和住宅灑淨。例如，放置病人上衣口袋，輕病速愈，重病不受冤親債主之搔擾；灑少許在額頭上或點在眉間可馬上消業；灑少許在家裏每個房間四角，若家裏有不淨會馬上被超度；灑在死去的小狗身上，助其離苦得樂超脫；灑少許在水族中，助其超脫。
使用時，每次約一指甲之量即可，以其所重者在加持力大小，而非分量多寡。撒於亡者額頭（兩眉間上方，約頭髮與眉毛中間）、心、喉、雙手（手心）等五處皆可。此外，金光明沙的使用不分時間，無論斷氣前或已斷氣，皆可撒少許置額上。