電動牙刷的清洗方法主要包括以下幾個步驟：
刷頭安裝。將刷頭和主機連線起來，注意不要用大力下壓，刷頭和主機之間保留1mm的間隙。
初次使用前的準備。初次使用前，先用溫水浸泡刷頭，不要用開水直接燙。
擠牙膏。擠完牙膏後，記得放入嘴中再開機，避免牙膏飛濺。
使用後清洗。每次用完牙刷後要徹底洗滌，並將水分儘量甩去。將牙刷頭朝上放在漱口杯里，或者放在通風有日光的地方，使它乾燥而殺菌。
使用清潔劑。可以使用白醋、酒精或小蘇打等清潔劑。將清潔劑倒入容器中，將電動牙刷的刷頭浸泡在清潔劑中，一般浸泡時間為10-15分鐘左右，浸泡完成後，用清水沖洗乾淨。
特殊污漬處理。對於黃色污漬，可以使用漂白劑或消毒液進行處理。將漂白劑或消毒液噴在面巾紙或毛巾上，裹在長有小黑點的地方，然後放置在一個乾燥的環境內，等上幾個小時，拿開毛巾/面巾紙就可以發現小黑點消失了。
此外，還可以使用84消毒液進行消毒處理，將電動牙刷的刷頭取下來，把刷柄放入84消毒液，讓刷柄發霉的部分浸泡在消毒液里，靜置幾個小時後，霉點就會消失。