霉豆子的製作方法主要有以下幾種：
傳統製作方法。將黃豆浸泡在冷水中一晚，煮熟至八分熟後瀝乾水分。將豆子放在淘米筲箕中，上面鋪一層稻草，等待發酵長出黴菌。當一層青綠色黴菌長出並消失後，將豆子放入容器中，加入鹽水密封三到五天。
快速製作方法。將新鮮毛豆蒸熟後晾涼，放入容器中密封放置。根據季節不同，放置時間約為5到7天。待表面長出霉後，可加入辣椒、姜等調料拌勻。
湖南風味製作方法。黃豆浸泡一晚後煮熟，瀝乾水分。放在溫暖的地方發酵，直到長出白色和綠色的黴菌。將調料如鹽、白糖、辣椒麵、白酒等與豆子拌勻，密封保存至少20天。
納豆製作方法。使用納豆菌粉與煮熟的黃豆拌勻，放入納豆機或容器中發酵約18小時，直到出現拉絲現象。加入喜歡的調料即可。
以上方法均可製作出霉豆子，但具體步驟和配料可能因個人口味和地區特色而有所不同。