非洲是多種病毒的發源地或高發區，包括但不限於以下幾種：
埃博拉病毒。一種高致死性的出血熱病毒，以剛果（金）的埃博拉河命名，首次爆發於1976年。
艾滋病病毒（HIV）。其最初來源被認爲是非洲的喀麥隆，通過黑猩猩和大猩猩身上的SIV病毒（猴免疫缺陷病毒）變異而來。
天花病毒。歷史上被完全消滅的病毒之一，其最早記錄出現在公元前1156年的古埃及法老拉美西斯五世的木乃伊上。
馬爾堡病毒。與埃博拉病毒類似，首次爆發於非洲，也是一種高致死性的出血熱病毒。
登革熱病毒。通過伊蚊傳播，主要在熱帶地區流行，其宿主可能是非洲的靈長類動物。
瘧疾。由瘧原蟲引起，通過按蚊傳播，是非洲最常見的傳染病之一。
此外，非洲還流行其他一些重要的病毒性疾病，如傷寒、昏睡病等。這些病毒的起源和傳播與非洲獨特的生態環境、野生動物種羣的豐富性以及當地人的生活方式密切相關。