香草莢的保存方法有多種，以下是幾種推薦的保存方式：
真空保存。使用後，將香草莢放入真空袋中，並儘可能排除袋內空氣，然後放在陰涼、乾燥、通風良好且避光的地方保存。
保鮮膜和密封容器。如果香草莢未使用完，可以用保鮮膜將其密封，並放置在陰涼避光處。此外也可將其放入密封性好的罐子或盒子中。
冷凍保存。將香草莢平鋪在真空袋或密封袋中，儘量排除空氣，然後將袋子放入塑膠密封盒內，再放入冰櫃冷凍室。使用時，取出小包，讓其自然回溫，並在24小時內使用。這種方法適合有真空包裝機或可以排除空氣的密封袋的用戶。
添加白砂糖保存。在密封盒中放入白砂糖，將香草莢放入盒中，可以讓白砂糖吸收香草莢的香氣。
無論哪種保存方法，都應注意避免潮濕環境，因為潮濕容易導致香草莢發霉。此外，應避免將香草莢放入冰櫃中，因為冰櫃內的濕度較高，可能導致香草莢發霉或吸收其他食物的味道。