區分馬尾鬥魚的公母可以通過以下幾個方面進行判斷：
體型和鰭形。公斗魚通常比母鬥魚更加修長，背鰭、臀鰭和尾鰭也比母魚更長、更寬大，且鰭的邊緣更鮮明。母鬥魚的體型較短胖，鰭形相對較小，邊緣較模糊。
顏色。公斗魚的顏色通常比母鬥魚更加鮮豔，色彩層次更豐富。母鬥魚的顏色相對較爲單一，通常爲暗淡的灰色或棕色。
生殖器官。雄性鬥魚的生殖器呈長管狀，位於腹部下方；雌性鬥魚的生殖器呈橢圓形，位於腹部中央。母鬥魚的腹部有一箇白黃色的生殖孔，且肚子通常較凸起；公斗魚的肚子平坦，生殖孔與母魚不同。
其他特徵。公魚的頭部可能比母魚大，有時會有額外的生長物，如頂冠或鼻須；母魚在成熟後腹部會有一箇突出的白點。
綜合這些特徵，可以較爲準確地判斷出馬尾鬥魚的性別。