高山族的信仰文化豐富多元，主要包括以下幾個方面：
原始宗教信仰。高山族保留了原始的宗教信仰和儀式，包括對精靈、天神、創造宇宙之神、自然神、司理神等的崇拜。這些信仰體現了高山族的泛神論觀念，他們認為宇宙萬物都充滿神秘的靈魂。例如，排灣人的圖騰藝術和祭祀儀禮反映了這種觀念。
藏傳佛教。高山族中也有信仰藏傳佛教的人士。
自然神靈崇拜。高山族信奉土地神、山神等自然神靈。
巫術與占卜。高山族社會盛行巫術，包括鳥卜、夢卜、水占、竹占、瓢占、飯占等多種占卜方法。
祖靈崇拜。高山族相信人死後靈魂不滅，並在默默中保佑後代。他們對祖先的崇拜是信仰中的重要部分，認為祖神可能附托在動物身上。
農事祭、狩獵祭、漁祭等。這些祭儀是高山族宗教生活中的重要組成部分，反映了他們對自然的崇拜和尊重。
此外，由於漢族移民和荷蘭、西班牙殖民者的影響，高山族宗教信仰變得更加複雜。漢族帶來了佛教，而西方侵略者則帶來了基督教和天主教。現在，高山族的宗教生活中形成了原始宗教信仰、佛教和西方宗教等交錯並立的局面。