去除鹿角藻的方法主要包括以下幾種：
使用戊二醛。準備2%濃度的戊二醛，對於40升的水草缸，若水質pH值7.0以上，每天添加不超過3毫升的戊二醛；若pH值7.0以下，每天添加不超過5毫升的戊二醛。連續處理三天，同時需要開啓過濾器以保持水循環。這種方法適用於大範圍的鹿角藻爆發。
剪除法。如果鹿角藻長在水草葉片上，可以直接將葉片剪掉。
大量換水。在用藥三天後，如果鹿角藻變紅，或者用藥第一天變紅，可以在第二天進行大量換水。建議的換水時間爲三天，以徹底去除鹿角藻孢子。
調節水質。如果原水質硬度較高，可以添加RO過濾水或純淨水進行調節，儘量使硬度GH維持在8左右，TDS維持在300左右。同時，添加鉀肥以促進水草生長，從而抑制鹿角藻的爆發。
定期換水。平時要注意控藻，定期進行換水，降低養殖密度與投餌量。
這些方法可以根據鹿角藻的情況和缸內生物的耐受性進行選擇。需要注意的是，在使用化學藥劑時，應確保劑量適當，以免對水草、魚類或其他生物造成不良影響。