黑玉米和普通玉米主要在外觀、口感、營養價值等方面有區別。具體如下：
外觀。黑玉米的外觀呈深紫色或黑色，表皮紫黑色，粒子較小且略微扁平，而普通玉米則表皮呈黃色或白色。
口感。黑玉米的口感相對於普通玉米來說更加甜美和嫩滑，顆粒柔軟多汁，帶有一些嚼勁，而普通玉米的口感可能更加脆甜。
營養價值。黑玉米富含花青素、類黃酮、類胡蘿蔔素、胡蘿蔔素等色素成分，以及更高的維生素C、維生素E、鈣、鐵、鋅等營養成分，花青素是一種強大的抗氧化劑，有助於保護心腦血管健康，黑玉米中的膳食纖維含量也更高，有助於促進腸道蠕動，預防便秘，而且黑玉米的蛋白質、胺基酸、鉀、維生素等營養成分含量也更高，營養價值高於普通玉米。
此外，黑玉米的生長時間一般要比普通玉米長，要求溫度和濕度條件更為嚴格。